Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rad23bP54728 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad23bP54728 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 217 ms