Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rad23aP54726 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rad23aP54726 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms