Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RabggtbP53612 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RabggtbP53612 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RabggtbP53612 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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