Protein–RNA interactions for Protein: P52850

Ndst2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst2P52850 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ndst2P52850 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndst2P52850 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms