Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna1P52793 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna1P52793 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna1P52793 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Efna1P52793 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna1P52793 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna1P52793 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna1P52793 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna1P52793 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna1P52793 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna1P52793 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Efna1P52793 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms