Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgd1P52734 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgd1P52734 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms