Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ube2e3P52483 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ube2e3P52483 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms