Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ClgnP52194 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClgnP52194 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClgnP52194 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClgnP52194 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ClgnP52194 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ClgnP52194 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ClgnP52194 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ClgnP52194 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ClgnP52194 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms