Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apobec1P51908 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms