Protein–RNA interactions for Protein: P51885

Lum, Lumican, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LumP51885 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LumP51885 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LumP51885 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LumP51885 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LumP51885 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LumP51885 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LumP51885 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LumP51885 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LumP51885 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LumP51885 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LumP51885 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LumP51885 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
LumP51885 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LumP51885 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LumP51885 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LumP51885 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LumP51885 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LumP51885 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LumP51885 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LumP51885 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LumP51885 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LumP51885 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LumP51885 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LumP51885 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LumP51885 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LumP51885 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LumP51885 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LumP51885 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LumP51885 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LumP51885 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LumP51885 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LumP51885 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LumP51885 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LumP51885 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LumP51885 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LumP51885 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LumP51885 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LumP51885 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LumP51885 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LumP51885 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LumP51885 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LumP51885 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LumP51885 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LumP51885 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LumP51885 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LumP51885 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LumP51885 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LumP51885 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LumP51885 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LumP51885 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LumP51885 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LumP51885 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LumP51885 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LumP51885 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LumP51885 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LumP51885 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LumP51885 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LumP51885 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LumP51885 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LumP51885 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LumP51885 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LumP51885 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LumP51885 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LumP51885 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LumP51885 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LumP51885 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LumP51885 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LumP51885 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LumP51885 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LumP51885 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LumP51885 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LumP51885 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LumP51885 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LumP51885 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LumP51885 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LumP51885 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LumP51885 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LumP51885 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LumP51885 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LumP51885 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LumP51885 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LumP51885 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LumP51885 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LumP51885 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LumP51885 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LumP51885 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LumP51885 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LumP51885 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LumP51885 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LumP51885 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LumP51885 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LumP51885 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LumP51885 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LumP51885 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LumP51885 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LumP51885 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LumP51885 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LumP51885 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LumP51885 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LumP51885 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms