Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccr5P51682 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms