Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr4P51680 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms