Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Opn1swP51491 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms