Protein–RNA interactions for Protein: P50992

Atp4b, Potassium-transporting ATPase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp4bP50992 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp4bP50992 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms