Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SftpdP50404 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SftpdP50404 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SftpdP50404 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SftpdP50404 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SftpdP50404 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms