Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd7P50283 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd7P50283 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd7P50283 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms