Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CitP49025 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CitP49025 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CitP49025 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CitP49025 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CitP49025 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CitP49025 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CitP49025 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CitP49025 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CitP49025 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CitP49025 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CitP49025 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CitP49025 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CitP49025 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CitP49025 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CitP49025 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CitP49025 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CitP49025 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CitP49025 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CitP49025 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CitP49025 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CitP49025 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CitP49025 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CitP49025 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CitP49025 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CitP49025 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CitP49025 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CitP49025 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CitP49025 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CitP49025 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CitP49025 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CitP49025 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CitP49025 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CitP49025 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CitP49025 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CitP49025 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CitP49025 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CitP49025 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CitP49025 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CitP49025 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CitP49025 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CitP49025 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CitP49025 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CitP49025 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CitP49025 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CitP49025 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CitP49025 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CitP49025 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CitP49025 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CitP49025 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CitP49025 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CitP49025 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CitP49025 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CitP49025 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CitP49025 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CitP49025 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CitP49025 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CitP49025 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CitP49025 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CitP49025 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CitP49025 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CitP49025 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CitP49025 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CitP49025 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CitP49025 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CitP49025 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CitP49025 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CitP49025 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CitP49025 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CitP49025 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CitP49025 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CitP49025 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CitP49025 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CitP49025 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CitP49025 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CitP49025 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CitP49025 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CitP49025 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CitP49025 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CitP49025 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CitP49025 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CitP49025 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CitP49025 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CitP49025 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CitP49025 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CitP49025 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CitP49025 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CitP49025 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CitP49025 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CitP49025 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CitP49025 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CitP49025 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CitP49025 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CitP49025 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CitP49025 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CitP49025 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CitP49025 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CitP49025 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CitP49025 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CitP49025 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms