Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl11P48298 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl11P48298 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccl11P48298 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl11P48298 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl11P48298 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl11P48298 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl11P48298 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl11P48298 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl11P48298 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccl11P48298 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccl11P48298 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl11P48298 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl11P48298 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl11P48298 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl11P48298 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccl11P48298 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl11P48298 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl11P48298 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl11P48298 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccl11P48298 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl11P48298 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl11P48298 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl11P48298 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl11P48298 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl11P48298 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl11P48298 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl11P48298 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl11P48298 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl11P48298 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl11P48298 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl11P48298 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl11P48298 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl11P48298 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl11P48298 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl11P48298 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl11P48298 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl11P48298 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl11P48298 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl11P48298 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl11P48298 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl11P48298 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl11P48298 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccl11P48298 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl11P48298 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl11P48298 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl11P48298 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccl11P48298 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccl11P48298 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl11P48298 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl11P48298 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl11P48298 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl11P48298 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl11P48298 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl11P48298 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl11P48298 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl11P48298 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl11P48298 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl11P48298 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl11P48298 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl11P48298 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl11P48298 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl11P48298 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl11P48298 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl11P48298 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl11P48298 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl11P48298 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl11P48298 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl11P48298 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl11P48298 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl11P48298 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl11P48298 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl11P48298 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl11P48298 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms