Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfaP48030 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfaP48030 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgfaP48030 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgfaP48030 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgfaP48030 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TgfaP48030 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TgfaP48030 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms