Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax9P47242 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax9P47242 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax9P47242 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax9P47242 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax9P47242 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pax9P47242 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax9P47242 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax9P47242 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pax9P47242 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms