Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf1P46099 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf1P46099 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klf1P46099 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf1P46099 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Klf1P46099 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf1P46099 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Klf1P46099 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf1P46099 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf1P46099 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf1P46099 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klf1P46099 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms