Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgavP43406 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgavP43406 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgavP43406 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ItgavP43406 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgavP43406 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgavP43406 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgavP43406 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ItgavP43406 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms