Protein–RNA interactions for Protein: P43300

Egr3, Early growth response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr3P43300 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Egr3P43300 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr3P43300 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr3P43300 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr3P43300 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Egr3P43300 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr3P43300 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Egr3P43300 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms