Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gdf5P43027 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gdf5P43027 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms