Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NodalP43021 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NodalP43021 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NodalP43021 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NodalP43021 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NodalP43021 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NodalP43021 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NodalP43021 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NodalP43021 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NodalP43021 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NodalP43021 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NodalP43021 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NodalP43021 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NodalP43021 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NodalP43021 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NodalP43021 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NodalP43021 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NodalP43021 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NodalP43021 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NodalP43021 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NodalP43021 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NodalP43021 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NodalP43021 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NodalP43021 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NodalP43021 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NodalP43021 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NodalP43021 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NodalP43021 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NodalP43021 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NodalP43021 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NodalP43021 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NodalP43021 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NodalP43021 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NodalP43021 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NodalP43021 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NodalP43021 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NodalP43021 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NodalP43021 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NodalP43021 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NodalP43021 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NodalP43021 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NodalP43021 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NodalP43021 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NodalP43021 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NodalP43021 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NodalP43021 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NodalP43021 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NodalP43021 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NodalP43021 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NodalP43021 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NodalP43021 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NodalP43021 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
NodalP43021 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NodalP43021 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NodalP43021 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NodalP43021 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NodalP43021 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NodalP43021 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NodalP43021 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NodalP43021 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NodalP43021 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NodalP43021 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NodalP43021 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NodalP43021 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NodalP43021 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NodalP43021 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NodalP43021 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NodalP43021 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NodalP43021 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NodalP43021 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NodalP43021 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NodalP43021 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NodalP43021 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NodalP43021 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NodalP43021 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NodalP43021 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NodalP43021 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NodalP43021 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NodalP43021 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NodalP43021 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NodalP43021 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NodalP43021 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NodalP43021 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NodalP43021 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NodalP43021 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NodalP43021 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NodalP43021 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NodalP43021 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NodalP43021 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NodalP43021 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NodalP43021 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NodalP43021 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NodalP43021 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NodalP43021 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NodalP43021 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NodalP43021 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NodalP43021 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NodalP43021 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NodalP43021 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NodalP43021 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms