Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nkx1-2P42580 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nkx1-2P42580 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms