Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LtbP41155 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LtbP41155 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LtbP41155 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LtbP41155 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LtbP41155 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LtbP41155 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LtbP41155 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LtbP41155 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LtbP41155 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LtbP41155 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LtbP41155 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LtbP41155 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LtbP41155 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LtbP41155 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LtbP41155 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LtbP41155 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LtbP41155 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LtbP41155 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LtbP41155 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LtbP41155 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LtbP41155 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LtbP41155 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LtbP41155 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LtbP41155 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LtbP41155 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LtbP41155 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LtbP41155 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LtbP41155 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LtbP41155 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LtbP41155 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LtbP41155 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LtbP41155 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LtbP41155 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LtbP41155 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LtbP41155 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LtbP41155 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LtbP41155 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LtbP41155 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LtbP41155 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LtbP41155 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbP41155 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbP41155 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbP41155 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbP41155 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbP41155 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbP41155 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbP41155 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbP41155 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbP41155 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbP41155 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbP41155 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbP41155 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbP41155 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbP41155 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbP41155 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbP41155 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbP41155 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LtbP41155 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbP41155 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbP41155 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbP41155 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbP41155 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbP41155 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbP41155 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbP41155 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbP41155 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbP41155 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbP41155 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LtbP41155 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms