Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik2P39087 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik2P39087 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik2P39087 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik2P39087 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik2P39087 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms