Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PpardP35396 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PpardP35396 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PpardP35396 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PpardP35396 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PpardP35396 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PpardP35396 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PpardP35396 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PpardP35396 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PpardP35396 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PpardP35396 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PpardP35396 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PpardP35396 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PpardP35396 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PpardP35396 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PpardP35396 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PpardP35396 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PpardP35396 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PpardP35396 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PpardP35396 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PpardP35396 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PpardP35396 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PpardP35396 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PpardP35396 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PpardP35396 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PpardP35396 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PpardP35396 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PpardP35396 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PpardP35396 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PpardP35396 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PpardP35396 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PpardP35396 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PpardP35396 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PpardP35396 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PpardP35396 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PpardP35396 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PpardP35396 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PpardP35396 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PpardP35396 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PpardP35396 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PpardP35396 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PpardP35396 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PpardP35396 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PpardP35396 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PpardP35396 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PpardP35396 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PpardP35396 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PpardP35396 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PpardP35396 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PpardP35396 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PpardP35396 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PpardP35396 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PpardP35396 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PpardP35396 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PpardP35396 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PpardP35396 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PpardP35396 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PpardP35396 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PpardP35396 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PpardP35396 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PpardP35396 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PpardP35396 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PpardP35396 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PpardP35396 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PpardP35396 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PpardP35396 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PpardP35396 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PpardP35396 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PpardP35396 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PpardP35396 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PpardP35396 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PpardP35396 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PpardP35396 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PpardP35396 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PpardP35396 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms