Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rab20P35295 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rab20P35295 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab20P35295 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab20P35295 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab20P35295 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab20P35295 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rab20P35295 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms