Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rab6aP35279 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms