Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pola2P33611 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pola2P33611 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pola2P33611 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pola2P33611 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pola2P33611 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pola2P33611 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms