Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pola1P33609 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pola1P33609 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pola1P33609 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pola1P33609 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pola1P33609 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pola1P33609 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pola1P33609 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pola1P33609 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pola1P33609 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pola1P33609 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms