Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nedd1P33215 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nedd1P33215 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nedd1P33215 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms