Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hoxc11P31313 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc11P31313 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms