Protein–RNA interactions for Protein: P30416

Fkbp4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP4, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fkbp4P30416 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fkbp4P30416 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fkbp4P30416 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fkbp4P30416 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fkbp4P30416 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms