Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VtnP29788 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VtnP29788 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VtnP29788 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VtnP29788 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VtnP29788 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VtnP29788 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VtnP29788 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VtnP29788 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VtnP29788 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VtnP29788 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VtnP29788 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VtnP29788 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
VtnP29788 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VtnP29788 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VtnP29788 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VtnP29788 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VtnP29788 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VtnP29788 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VtnP29788 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VtnP29788 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VtnP29788 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VtnP29788 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VtnP29788 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VtnP29788 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VtnP29788 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VtnP29788 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VtnP29788 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VtnP29788 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VtnP29788 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VtnP29788 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VtnP29788 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VtnP29788 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VtnP29788 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VtnP29788 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VtnP29788 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VtnP29788 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VtnP29788 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VtnP29788 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VtnP29788 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VtnP29788 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VtnP29788 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VtnP29788 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VtnP29788 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VtnP29788 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VtnP29788 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VtnP29788 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VtnP29788 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VtnP29788 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VtnP29788 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VtnP29788 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VtnP29788 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VtnP29788 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VtnP29788 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VtnP29788 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VtnP29788 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VtnP29788 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VtnP29788 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VtnP29788 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VtnP29788 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VtnP29788 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VtnP29788 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VtnP29788 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VtnP29788 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VtnP29788 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VtnP29788 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VtnP29788 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VtnP29788 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VtnP29788 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VtnP29788 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms