Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtgfP29268 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtgfP29268 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtgfP29268 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtgfP29268 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtgfP29268 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CtgfP29268 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtgfP29268 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtgfP29268 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtgfP29268 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CtgfP29268 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms