Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Etv4P28322 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Etv4P28322 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Etv4P28322 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Etv4P28322 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Etv4P28322 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Etv4P28322 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Etv4P28322 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Etv4P28322 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Etv4P28322 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Etv4P28322 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Etv4P28322 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Etv4P28322 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Etv4P28322 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Etv4P28322 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Etv4P28322 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Etv4P28322 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Etv4P28322 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Etv4P28322 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Etv4P28322 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Etv4P28322 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Etv4P28322 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Etv4P28322 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Etv4P28322 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Etv4P28322 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Etv4P28322 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Etv4P28322 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms