Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Psmb9P28076 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb9P28076 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb9P28076 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb9P28076 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb9P28076 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb9P28076 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb9P28076 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb9P28076 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb9P28076 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb9P28076 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb9P28076 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb9P28076 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb9P28076 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Psmb9P28076 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms