Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CebpbP28033 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpbP28033 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpbP28033 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpbP28033 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpbP28033 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpbP28033 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CebpbP28033 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CebpbP28033 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms