Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpbP27790 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpbP27790 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpbP27790 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CenpbP27790 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CenpbP27790 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CenpbP27790 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpbP27790 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CenpbP27790 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CenpbP27790 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CenpbP27790 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CenpbP27790 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms