Protein–RNA interactions for Protein: P27681

Gabrg3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg3P27681 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gabrg3P27681 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms