Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PdgfraP26618 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PdgfraP26618 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms