Protein–RNA interactions for Protein: P26350

Ptma, Prothymosin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtmaP26350 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtmaP26350 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtmaP26350 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtmaP26350 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PtmaP26350 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtmaP26350 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtmaP26350 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtmaP26350 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtmaP26350 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtmaP26350 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms