Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ChgaP26339 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ChgaP26339 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChgaP26339 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ChgaP26339 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChgaP26339 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ChgaP26339 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChgaP26339 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChgaP26339 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ChgaP26339 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChgaP26339 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChgaP26339 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms