Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lmo2P25801 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lmo2P25801 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms