Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf239P24399 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Znf239P24399 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf239P24399 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf239P24399 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Znf239P24399 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms