Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd247P24161 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd247P24161 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd247P24161 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd247P24161 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd247P24161 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd247P24161 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd247P24161 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd247P24161 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd247P24161 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms