Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria1P23818 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria1P23818 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gria1P23818 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gria1P23818 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms